Cent Eur J Public Health 2023, 31(4):235-239 | DOI: 10.21101/cejph.a7906

Possible effect of OAS1 and TMPRSS6 but not DPP4 and ZNF335 polymorphisms on COVID-19 severity in the Czech population

Jaroslav A. Hubáček1, 2, Tom Philipp3, Věra Adámková4, Ondřej Májek5, 6, Dana Dlouhá1, Ladislav Dušek5, 6
1 Experimental Medicine Centre, Institute for Clinical and Experimental Medicine, Prague, Czech Republic
2 Department of Endocrinology and Metabolism, Third Department of Internal Medicine, First Faculty of Medicine, Charles University and General University Hospital, Prague, Czech Republic
3 Clinic of Rheumatology and Physiotherapy, Third Faculty of Medicine, Charles University and Thomayer University Hospital, Prague, Czech Republic
4 Department of Preventive Cardiology, Institute for Clinical and Experimental Medicine, Prague, Czech Republic
5 Institute of Health Information and Statistics of the Czech Republic, Prague, Czech Republic
6 Institute of Biostatistics and Analyses, Faculty of Medicine, Masaryk University, Brno, Czech Republic

Objectives: The acute respiratory syndrome, known as COVID-19, is characterised by high morbidity and increased mortality. Genetic factors may partially explain the differences in susceptibility to and severity of COVID-19.

Methods: We have analysed common functional polymorphisms within the OAS1 (rs4767027), TMPRSS6 (rs855791), DPP4 (rs3788979), and ZNF335 (rs3848719) genes in SARS-CoV-2 positive subjects (n = 521, different disease severity) and in population controls (n = 2,559 subjects, COVID-19 status unknown).

Results: Neither DPP4 nor ZNF335 were associated with disease susceptibility or severity in the Czech population in any of the models used for calculation. T allele carriers of the OAS1 polymorphism seem to be protective against symptomatic COVID-19 (p = 0.002 calculated for trend; asymptomatic, symptomatic, hospitalised). Similarly, within the TMPRSS6, minor TT homozygotes associated with lower plasma Fe concentrations were underrepresented in the overall patient group (p = 0.044; OR = 0.77, 95% CI: 0.59-0.99), and the difference was mainly driven by the severe COVID-19 subjects. In general, risky homozygotes of these two polymorphisms were less frequent than expected in the group of hospitalised COVID-19 survivors.

Conclusions: Common variants within OAS1 (rs4767027) and TMPRSS6 (rs855791) play some role in COVID-19 pathology in the Czech Caucasian population. Whether the depletion of minor allele carriers of these two variants is associated with increased COVID-19 mortality, needs to be analysed in an external confirmatory study.

Klíčová slova: COVID-19, DPP4, OAS1, polymorphism, SARS-CoV-2, severity, TMPRSS6, ZNF335

Vloženo: 1. červen 2023; Revidováno: 5. říjen 2023; Přijato: 5. říjen 2023; Zveřejněno: 30. prosinec 2023  Zobrazit citaci

ACS AIP APA ASA Harvard Chicago Chicago Notes IEEE ISO690 MLA NLM Turabian Vancouver
Hubáček JA, Philipp T, Adámková V, Májek O, Dlouhá D, Dušek L. Possible effect of OAS1 and TMPRSS6 but not DPP4 and ZNF335 polymorphisms on COVID-19 severity in the Czech population. Cent Eur J Public Health. 2023;31(4):235-239. doi: 10.21101/cejph.a7906. PubMed PMID: 38309700.
Stáhnout citaci

Reference

  1. Tuček M. COVID-19 in the Czech Republic 2020: probable transmission of the coronavirus SARS-CoV-2. Cent Eur J Public Health. 2021;29(2):159-61. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  2. Komenda M, Jarkovský J, Klimeš D, Panoška P, Šanca O, Gregor J, et al. Sharing datasets of the COVID-19 epidemic in the Czech Republic. PLoS One. 2022;17(4):e0267397. doi: 10.1371/journal.pone.0267397. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  3. Hippisley-Cox J, Young D, Coupland C, Channon KM, Tan PS, Harrison DA, et al. Risk of severe COVID-19 disease with ACE inhibitors and angiotensin receptor blockers: cohort study including 8.3 million people. Heart. 2020;106(19):1503-11. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  4. Zsichla L, Müller V. Risk factors of severe COVID-19: a review of host, viral and environmental factors. Viruses. 2023;15(1):175. doi: 10.3390/v15010175. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  5. Schmidt A, Groh AM, Frick JS, Vehreschild MJGT, Ludwig KU. Genetic predisposition and the variable course of infectious diseases. Dtsch Arztebl Int. 2022;119(8):117-23. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  6. Vannberg FO, Chapman SJ, Hill AV. Human genetic susceptibility to intracellular pathogens. Immunol Rev. 2011;240(1):105-16. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  7. Paces J, Strizova Z, Smrz D, Cerny J. COVID-19 and the immune system. Physiol Res. 2020;69(3):379-88. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  8. Hubacek JA. Effects of selected inherited factors on susceptibility to SARS-CoV-2 infection and COVID-19 progression. Physiol Res. 2021;70(S2):S125-34. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  9. Delanghe JR, Speeckaert MM. Host polymorphisms and COVID-19 infection. Adv Clin Chem. 2022;107:41-77. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  10. Colona VL, Vasiliou V, Watt J, Novelli G, Reichardt JKV. Update on human genetic susceptibility to COVID-19: susceptibility to virus and response. Hum Genomics 2021;15(1):57. doi: 10.1186/s40246-021-00356-x. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  11. Edeas M, Saleh J, Peyssonnaux C. Iron: innocent bystander or vicious culprit in COVID-19 pathogenesis? Int J Infect Dis. 2020;97:303-5. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  12. Delanghe JR, De Buyzere ML, Speeckaert MM. Genetic polymorphisms in the host and COVID-19 infection. Adv Exp Med Biol. 2021;1318:109-18. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  13. Hubacek JA, Philipp T, Adamkova V, Majek O, Dusek L. A haemochromatosis-causing HFE mutation is associated with SARS-CoV-2 susceptibility in the Czech population. Clin Chim Acta. 2023;538:211-5. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  14. Lee P. Role of matriptase-2 (TMPRSS6) in iron metabolism. Acta Haematol. 2009;122(2-3):87-96. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  15. Galesloot TE, Geurts-Moespot AJ, den Heijer M, Sweep FC, Fleming RE, Kiemeney LA, et al. Associations of common variants in HFE and TMPRSS6 with iron parameters are independent of serum hepcidin in a general population: a replication study. J Med Genet. 2013;50(9):593-8. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  16. Esposito S, D'Abrosca G, Antolak A, Pedone PV, Isernia C, Malgieri G. Host and viral zinc-finger proteins in COVID-19. Int J Mol Sci. 2022;23(7):3711. doi: 10.3390/ijms23073711. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  17. Qin S, Xu W, Wang C, Jiang S, Dai W, Yang Y, et al. Analyzing master regulators and scRNA-seq of COVID-19 patients reveals an underlying anti-SARS-CoV-2 mechanism of ZNF proteins. Brief Bioinform. 2021;22(5):bbab118. doi: 10.1093/bib/bbab118. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  18. Shortt K, Chaudhary S, Grigoryev D, Heruth DP, Venkitachalam L, Zhang LQ, et al. Identification of novel single nucleotide polymorphisms associated with acute respiratory distress syndrome by exome-seq. PLoS One. 2014;9(11):e111953. doi: 10.1371/journal.pone.0111953. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  19. Solerte SB, Di Sabatino A, Galli M, Fiorina P. Dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) inhibition in COVID-19. Acta Diabetol. 2020;57(7):779-83. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  20. Sebastián-Martín A, Sánchez BG, Mora-Rodríguez JM, Bort A, Díaz-Laviada I. Role of dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) on COVID-19 physiopathology. Biomedicines. 2022;10(8):2026. doi: 10.3390/biomedicines10082026. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  21. Posadas-Sánchez R, Sánchez-Muñoz F, Guzmán-Martín CA, Hernández-Díaz Couder A, Rojas-Velasco G, Fragoso JM, et al. Dipeptidylpeptidase-4 levels and DPP4 gene polymorphisms in patients with COVID-19. Association with disease and with severity. Life Sci. 2021;276:119410. doi: 10.1016/j.lfs.2021.119410. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  22. Zeberg H, Pääbo S. The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neanderthals. Nature. 2020;587:610-2. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  23. Zhou S, Butler-Laporte G, Nakanishi T, Morrison DR, Afilalo J, Afilalo M, et al. A Neanderthal OAS1 isoform protects individuals of European ancestry against COVID-19 susceptibility and severity. Nat Med. 2020;27(7835):659-67. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  24. Hubacek JA, Dusek L, Majek O, Adamek V, Cervinkova T, Dlouha D, et al. CCR5Delta32 deletion as a protective factor in Czech first-wave COVID-19 subjects. Physiol Res. 2021;70(1):111-5. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  25. Hubacek JA, Dusek L, Majek O, Adamek V, Cervinkova T, Dlouha D, et al. ACE I/D polymorphism in Czech first-wave SARS-CoV-2-positive survivors. Clin Chim Acta. 2021;519:206-9. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  26. Hubacek JA, Philipp T, Adamkova V, Majek O, Dusek L. ABCA3 and LZTFL1 polymorphisms and risk of COVID-19 in the Czech Population. Physiol Res. 2023;72(4):539-43. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  27. Cífková R, Skodová Z, Bruthans J, Adámková V, Jozífová M, Galovcová M, et al. Longitudinal trends in major cardiovascular risk factors in the Czech population between 1985 and 2007/8. Czech MONICA and Czech post-MONICA. Atherosclerosis. 2010;211(2):676-81. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  28. Hubácek JA, Adámková V, Ceska R, Poledne R, Horínek A, Vráblík M. New variants in the apolipoprotein AV gene in individuals with extreme triglyceride levels. Physiol Res. 2004;53(2):225-8. Přejít k původnímu zdroji...
  29. Gokul A, Arumugam T, Ramsuran V. Genetic ethnic differences in human 2'-5'-oligoadenylate synthetase and disease associations: a systematic review. Genes (Basel). 2023;14(2):527. doi: 10.3390/genes14020527. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  30. COVID-19 Host Genetics Initiative. Mapping the human genetic architecture of COVID-19. Nature. 2021;600(7889):472-7.